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HIV基因編輯技術(shù)介紹

更新時間:2024-02-04      點擊次數(shù):823

基因編輯技術(shù)在艾滋病毒研究中展現(xiàn)出前景

用于編輯基因的 CRISPR/Cas 系統(tǒng)的發(fā)展正在改變基因工程。1 , 2與 HIV 感染等疾病過程相關(guān)的生物途徑尤其令人感興趣。3 HIV 通過感染和破壞免疫系統(tǒng)細胞,特別是對哺乳動物適應(yīng)性免疫反應(yīng)至關(guān)重要的 T 細胞,對免疫系統(tǒng)造成嚴重損害。不同的研究實驗室開發(fā)了 CRISPR/Cas 基因編輯模型,試圖減少 HIV 感染。

CRISPR/Cas最初被發(fā)現(xiàn)是原核適應(yīng)性免疫系統(tǒng)的關(guān)鍵組成部分。 CRISPR 代表成簇規(guī)則間隔的短回文重復(fù),它們是包含堿基 DNA 序列短重復(fù)的原核 DNA 片段。重復(fù)序列由短間隔外源 DNA 分隔開,該外源 DNA 源自原核生物(細菌和古細菌)先前暴露于質(zhì)?;蚴删w病毒。

CRISPR 與 CRISPR 相關(guān) (CAS) 基因協(xié)調(diào)發(fā)揮作用,使原核適應(yīng)性免疫系統(tǒng)能夠識別、響應(yīng)和消除外源 DNA。 CRISPR/Cas基因編輯被稱為分子剪刀,因為它本質(zhì)上是從原核生物基因組中剪掉外源DNA(質(zhì)粒和噬菌體)。原核生物中的 CRISPR/Cas 基因編輯類似于真核生物中的 RNA 干擾或基因沉默。

原核 CRISPR/Cas 機制被用來開發(fā)一系列豐富的編輯工具,例如用于哺乳動物細胞的 CRISPR/Cas9。 CRISPR/Cas9 有兩個主要組件:Cas9 和 RNA 向?qū)В笳咄ㄟ^互補核苷酸結(jié)合將 Cas9 靶向特定的 DNA 片段。 Cas9 是一種核酸內(nèi)切酶,通過與向?qū)?RNA 結(jié)合,以序列特異性方式切割雙鏈 DNA。指導(dǎo) RNA 包含與目標(biāo) DNA 配對的核苷酸。

RNA 向?qū)Ы?jīng)過基因工程改造,可與選定的基因靶標(biāo)配對,并與 Cas9 一起遞送至細胞。當(dāng) RNA 引導(dǎo) Cas9 到達目標(biāo)基因組序列時,它允許 Cas9 在基因組中選定的目標(biāo)點切割兩條 DNA 鏈。然后可以在 Cas9 切割位點修改、插入或去除 DNA。

研究人員設(shè)計了 RNA 向?qū)碇笇?dǎo) Cas9 切割含有必需基因或長末端重復(fù)序列的 HIV 病毒 DNA 的不同區(qū)域。3 CRISPR/Cas9 基因編輯可顯著抑制各種研究細胞模型中的 HIV 病毒產(chǎn)生和感染,包括人類多能干細胞、原代 CD4+ T 細胞和 CD4+ T 細胞系。理論上,消除感染細胞中病毒表達所必需的HIV病毒DNA或基因應(yīng)該能夠滅活或消除HIV感染。

不幸的是,研究人員還在一些實驗中發(fā)現(xiàn)細胞產(chǎn)生了 CRISPR/Cas9 抗性突變。當(dāng) Cas9 被引導(dǎo)切割時,這些突變聚集在病毒位點。 Cas9 無法切割目標(biāo)位點,因此 CRISPR/CAS9 攻擊無效。3 HIV 與其他病毒一樣,具有進化出對其他攻擊機制(例如人類免疫系統(tǒng)和抗病毒的藥物)的抵抗力的能力。

在另一種對抗 HIV-1 感染的方法中,CRISPR/Cas9 已被用來消除趨化因子受體 5 型 (CCR5) 的表達。4CCR5 是一種輔助受體,某些 HIV 類型需要 CCR5 才能進入 T 細胞并引起 HIV 感染。研究人員利用靶向 CCR5 的 CRISPR/CAS9 載體破壞了 CD34 陽性造血干細胞和祖細胞中的 CCR5 基因。研究人員表明,CCR-5 突變克隆保留了分化為多種造血譜系的能力,并且很少引入脫靶突變。這很重要,因為安全性是基因編輯技術(shù)重要問題。因此,有必要證明經(jīng)過編輯的細胞仍然可以發(fā)揮作用,并避免意外的、可能有害的突變。 CRISPR/CAS 系統(tǒng)的成功和局限性的認識都在推動優(yōu)化策略。

重要的是,突變 CCR5 的策略已在使用鋅指核酸酶 (ZFN) 的初步臨床醫(yī)學(xué)研究試驗中成功進行了測試。 ZFN 與 CRISP/Cas 一樣,也是有前途的基因編輯分子剪刀工具,用于減少細胞中 HIV 的表達。 ZFN 是通過將 DNA 切割核酸酶結(jié)構(gòu)域與鋅指 DNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)域融合而生成的。與 CRISPR/Cas 技術(shù)中使用的 RNA 向?qū)б粯?,鋅指結(jié)構(gòu)域可以被設(shè)計為靶向特定的 DNA。含有 Fok1 限制性酶的核酸酶結(jié)構(gòu)域是分子剪刀組件,可催化切割目標(biāo) DNA。 SB-728-T,也稱為 CCR5-ZFN,是一種研究性基因治療 ZFN 藥物(clinicaltrials.gov:NCT01543152、NCT01252641 和 NCT01044654)。

CCR5-ZFN 的機制基于 CCR5 的基因工程修飾,使 CCR5 失去功能,細胞對 HIV 感染具有更強的抵抗力。 CCR5-ZFN 試劑是從給定個體獲得的自體 T 細胞,例如 CD4+ T 細胞,通過鋅指核酸酶對 CCR5 基因進行遺傳修飾,然后重新引入宿主生物體。修改后的 CCR5 基因座可能消除 HIV 進入并感染 T 細胞的一個場所(CCR5 受體)。4 CCR5-ZFN/SB-728-T 用于研究以確定 CCR5 轉(zhuǎn)基因細胞是否能夠抵抗 HIV 感染。研究人員還渴望確定 CCR5-ZFN/SB-728-T 是否可以將自身復(fù)制到其他耐藥細胞中,并通過阻止 HIV 進入細胞來恢復(fù)受感染宿主的免疫細胞功能。

MyBioSource 提供以下用于基因編輯研究用途的產(chǎn)品:

  • 人趨化因子受體 5 型 (CCR5),ELISA 試劑盒(目錄號 #MBS2020083)

  • CRISPR/Cas9,單克隆抗體(貨號#MBS375383)

  • 化膿性鏈球菌 CRISPR 相關(guān)蛋白 9 核酸酶,重組蛋白(目錄號 #MBS140642)

  • HIV(人類免疫缺陷病毒)ELISA 試劑盒(貨號#MBS766122)

  • HIV-2 gp39,單克隆抗體(貨號#MBS430025)

  • HIV Gp41/gg36,重組蛋白(貨號#MBS319756)

  • HIV-1 p24,單克隆抗體(貨號#MBS8241470)

  • HIV-1 Tat 相互作用蛋白 2 單克隆抗體 ELISA 試劑盒(產(chǎn)品目錄號 #MBS732587)


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